27 ноября 2006 г. началась повторная партнерская проверка Балаковской АЭС экспертами Московского центра ВАО АЭС (Всемирной ассоциации организаций, эксплуатирующих атомные станции). В состав команды экспертов входят представители АЭС России (Кольской и Курской) и Украины (Хмельницкой, Южно-Украинской, Ровенской и Запорожской).
Данная партнерская проверка осуществляется по результатам партнерской проверки, проведенной на Балаковской АЭС в 2003 году экспертами, представлявшими атомную энергетику России, Украины, Литвы, США и Индии. В своем отчете они констатировали высокий уровень профессионализма специалистов Балаковской АЭС, а также сформулировали возможные области для дальнейшего улучшения ее деятельности.
После партнерской проверки 2003 г. на Балаковской АЭС проведен значительный объем мероприятий по модернизации оборудования, реализованы крупные проекты в области повышения уровня безопасности эксплуатации станции. В ходе повторной партнерской проверки экспертам ВАО АЭС предстоит дать оценку этой работе.
Балаковская АЭС является пионером среди российских атомных станций в проведении партнерских проверок. Именно Балаковская АЭС первой из АЭС России прошла такую проверку, проведенную в 1995 году экспертами Атлантского регионального центра ВАО АЭС (США).